Hepatobilier hastalıklar, serum ALP aktivitesinin artişına neden olur. Safra kanalı tıkanmasina yanıt olarak karaciğerde ALP sentezi artar. Yeni enzim sentezi safra kanalına komşu hepatositlerde olur. Bu hepatositlerden kana dökülen enzim, ALP'nin serum seviyelerini arttırır. Karaciğer kanserlerinde ve metastazlarında da serum ALP aktiviteleri yüksek seyreder.
Osteoblastik aktivite artışı ile giden hastalıklar da ALP'yi arttırırlar. Kemik hastalıkları içinde, en yüksek serum ALP düzeylerine Paget hastalığında rastlanır. Paget'de osteoklastların kontrol edilemeyen aktiviteleri sonucu rezorbe olan kemiğin yeniden yapılması için osteoblastik aktivite çok artar. Osteomalazi, raşitizm, primer-sekonder hiperparatiroidiler, osteojenik kemik kanserleri ve kırık kemiklerin iyileşme dönemi ALP'nin kemik izoenziminin arttığı diğer durumlardır.
Hamileliğin 3. trimestrinda yükselen plasental ALP düzeyleri serum ALP'sini yükseltir. Gebelikte hipertansiyon ve preeklampsi gibi durumlarda, tekrarlayan ölçümlerindeki ALP'nin değişiklikleri komplikasyonlar için haberci olabilir.
GGT enzimi hepatobiliyer sistem hücrelerinde yüksek oranda temsil edildiğinden, özellikle bu bölgenin bozukluklarında, özellikle tıkanma sarılığı, intrahepatik kolestaz, gebelik kolestazı, pankreatit, karaciğer metastazı, alkol/toksin/ilaç kaynaklı karaciğer hastalığı, enfeksiyöz mononükleoz, konjestif kalp yetmezliği, primer biliyer siroz veya biliyer atrezide yükselir.
Olası/doğrulanmış hepatobiliyer obstrüksiyonu olan bir hastayı değerlendirirken- yüksek GGT, ALP ve (konjuge) bilirubin üçlüsünü aramalıdır.
Hepatik konjesyonu yansıtan GGT'nin ve folat-kobalamin eksikliğini ve/veya kemik iliği toksisitesini düşündüren MCV'nin birlikte yükselmeleri alkol kötüye kullanımını düşündürebilir.
Sistemik lupus eritematozus (SLE) veya hipertiroidizm ile GGT'de daha hafif yükselmeler görülebilir.
GGT en duyarlı laboratuvar olarak kabul edilir hepatobiliyer obstrüksiyon için belirteçtir; lösin aminopeptidaz (LAP) veya 5' nükleotidaz ek/doğrulayıcı testlerdir.
Karaciğer veya kemik bozukluklarında yükselebilen (dolayısıyla tanısal bir ikileme neden olması muhtemel olan) ALP'den farklı olarak GGT'nin kaynağı kemik değildir.
İnsülin direnci /diabetes mellitus tip-2/metabolik sendrom glutatyon ve detoksifikasyon sistemlerinin artan aktivitesi arasında bir orantı vardır. Kalıcı organik kirleticilerin artan vücut yüküne yanıt olarak artar.
Protein sentezindeki toplam azalmanın bir yansıması olarak hipotiroidizmde GGT seviyeleri azalır
Oral kontraseptif ajanlar ve klofibrat kullanımında da GGT azaltabilir.
GGT oksidatif stres ve ksenobiyotik maruziyetinin de olası bir belirtecidir.